Bagel を使ってみて、変更されたファイルを洗いだしてみました。
C:\WINNT\system32\config\software.LOG
D:\bg\bagelprofile\profiles\tgbdefault\Cache\*.*
D:\bg\bagelprofile\profiles\tgbdefault\dmgoztfa.slt\cookies.txt
D:\bg\bagelprofile\profiles\tgbdefault\dmgoztfa.slt\history.dat
D:\bg\Default.bbg
きちんと自分のフォルダー内で閉じています。
個人情報の流出などに対しても、USBメモリースティクでの持ち運びに対しても問題ないようです。
注)software.LOG は、同フォルダー C:\WINNT\system32\config\software の差分情報です。
config\software は、HKEY_LOCAL_MACHINE の HKLM\SOFTWARE で、OSやインストール済ソフトウェアの情報で個人情報は含まないはずです。
さらに、この .LOG は本体に変更が無い場合も作成されています。